摘要: 01 关于我们 | WHO WE ARE 《生物信息与育种》 是一个深耕生物信息学与现代智能育种技术的专业交流平台。 我们大概在2015年埋下种子,于2023年10月开始生根发芽、频繁更新。我们致力于将生物信息、AI大数据、云计算、高通量表型组等前沿交叉技术,真正应用于现代生物育种实践。 我们的愿景 阅读全文
posted @ 2026-04-29 14:54 生物信息与育种 阅读(5) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 辞职有一阵子了,陆续有朋友好奇,问我怎么出来了。 现在回过头看这个选择,原因挺多,挑些能说的聊聊。 打工的目的说白了就是要给自己赎身,不可能打一辈子,也没有哪个公司能让你安安稳稳待到退休。 为什么不去体制?之前不是没想过,但靠那份收入养不活一家人。 如今已过35,此路不通。 再说,这世上只有相对的稳 阅读全文
posted @ 2026-04-29 14:48 生物信息与育种 阅读(200) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 最近一直在忙,但之前立的这个 flag 还是要补上,毕竟金三银四也快过去了。 从科研到打工,再到带团队,最后出来自己做,我在生信这一行前后十多年,面过的人不算少,也接触过各种背景的候选人,包括名校博士和博后。 这篇就从一个业务面试官的角度,聊一聊我通常怎么面试生信工程师,以及我更看重什么能力。仅供参 阅读全文
posted @ 2026-04-13 09:44 生物信息与育种 阅读(31) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 前段时间有朋友让我们帮忙复现一篇文章中的GS方法,并提供定制化代码:详见上期:【项目案例】定制7种常见基因组选择(GS)模型的核心代码。 我们想反正都是主流算法,写完了不用也就荒废在那了,不如分享给其他有需要的朋友。当然,我们是商业化团队,是需要收一点费用的。 没想到还是有不少朋友对这个脚本感兴趣的 阅读全文
posted @ 2026-04-03 16:48 生物信息与育种 阅读(8) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 系列报告 基因组选择(GS)让育种进入预测时代 全基因组选择:理论探讨 基因组选择(GS)如何加速作物遗传增益? Computomics:利用先进的机器学习实现预测性植物育种 基因组选择:加速遗传增益,缩短育种周期 基因组选择在水稻育种中的应用与效果 【报告解读】构建可复制和可推广的基因组预测模型 阅读全文
posted @ 2025-10-26 20:21 生物信息与育种 阅读(303) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 2025年10月,国际水稻研究所(IRRI)公开发布了其水稻育种现代化的核心成果——Onerice育种框架,其宣称该框架已在IRRI及其合作伙伴的育种网络中全面落地。那么,今天我们来了解一下这个Onerice育种框架到底是个什么。 基于OneRice开发的优质水稻品种,以适应优先市场细分。图片来源于 阅读全文
posted @ 2026-05-07 10:36 生物信息与育种 阅读(4) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 基因挖掘与性状定位是连接表型变异与底层核酸序列差异的关键桥梁。长沙米源生物科技有限公司依托高密度变异图谱与多组学生信算力,构建涵盖全基因组关联分析、高密度遗传图谱构建及极端混池分组分析的高效挖掘体系,旨在为复杂数量性状与单基因突变性状提供精确的分子标记与候选功能靶标。 一、基因挖掘核心服务体系 1. 阅读全文
posted @ 2026-05-06 15:17 生物信息与育种 阅读(0) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 最近在一对一辅导一位同学做全基因组关联分析(GWAS)项目。他在处理一批水稻的数据时,使用 rMVP 跑流程遇到了几个非常典型的坑。从上千万个原始变异位点的质控过滤,到代码报错排查,再到最终模型选择,在这里记录总结下,供开展植物 GWAS 的同行参考。 一、 过滤位点过犹不及 在使用 PLINK 对 阅读全文
posted @ 2026-05-05 11:47 生物信息与育种 阅读(5) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 近日,华中农业大学胡学海&上海交通大学陆钰明团队在Plant Communications 发表了题为TargetGAN: A generative AI framework for designing plant core promoters with targeted activity 的研究文 阅读全文
posted @ 2026-05-04 15:50 生物信息与育种 阅读(10) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 陆地植物约有45万个物种,构成了陆地生态系统的根基,也支撑着人类文明。从不足0.1Gb到超过160Gb的基因组大小,从以单倍体配子体为主到以二倍体孢子体为主的生活史,从根、叶、花、果等复杂器官的诞生到退化或高度特化,陆地植物展现出了惊人的形态、核型、生态和生理多样性。然而,这些多样性的基因组基础,至 阅读全文
posted @ 2026-05-03 13:56 生物信息与育种 阅读(26) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 分享近期一篇发表在 Communications Biology 上比较接地气的文章:Large scale wheat data integration improves genomic prediction accuracy with the potential to facilitate in 阅读全文
posted @ 2026-05-03 13:47 生物信息与育种 阅读(5) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 全基因组重测序(Whole Genome Resequencing, WGRS)是对已知参考基因组序列的物种进行个体或群体测序,通过与参考图谱比对,全景式鉴定单核苷酸多态性(SNP)、小片段插入缺失(InDel)、结构变异(SV)及拷贝数变异(CNV)等遗传变异。该技术是开展种质资源评价、群体演化解 阅读全文
posted @ 2026-04-30 16:26 生物信息与育种 阅读(11) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 近期,张志武&王嘉博老师在Molecular Biology and Evolution上发表GAPIT Version 4。 GAPIT 第4版的核心是将全基因组关联分析(GWAS)结果整合到基因组预测(GP)中,提出了一种称为 GAGBLUP(GWAS-Assisted Genomic BLUP 阅读全文
posted @ 2026-04-29 14:49 生物信息与育种 阅读(20) 评论(0) 推荐(0)