小鲨鱼2018

摘要： 001、当使用相同的遗传信息来源时 当估计个体育种值时，如果所依据的遗传信息来源相同，那么无论是否引入遗传力，对选择效果实际上没有差别。例如，当所有个体的育种值都仅根据其自身一次测定的表型值来估计时，可用公式 育种值A = (P - 群体均值)h² + 群体均值。 在同一群体内，由于各个体的遗传参数 阅读全文

摘要： 001、 [root@PC1 test]# ls a.txt [root@PC1 test]# cat a.txt ## 测试文本 NC_056054.1 404 2 0 G -nan GA -nan nan NC_056054.1 501 2 6 A 1 G 0 0 NC_056054.1 506 阅读全文

摘要： 01、 选择指数法1 将个体单个性状不同信息来源（即：个体本身成绩，祖先成绩，同胞成绩和后裔成绩）分别进行适当的加权，并合并为一个数值，这个数值可以尽可能准确地反映个体的遗传水平，如果多个个体都利用此法评定它们的遗传素质，就可以根据其数值大小进行排队，作为选择留种的标准，上述这种估算出来的数值称为选 阅读全文

摘要： 育种值估计： 方差组分和协方差组分估计，估计性状的重复力、遗传力、性状间的表型相关和遗传相关，估计个体育种值。 个体的育种值是可以稳定遗传的，根据它选种可以获得最大的遗传进展，但是育种值不能够直接度量得到，能够知道的只有包含育种值在内的各种遗传效应和环境效应共同作用的表型值。只能利用统计分析方法，通 阅读全文

摘要： 001、 目标选择指数法：用选育目标代替指数中的经济系数权重，比较稳定和实用（目标选择指数法是相对于综合选择指数法而言的）。 制定选择指数的前提：需要知道遗传力（每个性状的表型方差和遗传方差）、遗传相关（每对性状的表型协方差和遗传协方差）和经济重要性（每改良一个单位性状可以带来的经济效益）。 阅读全文

摘要： 001、linux 中 将plink --distance square 1-ibs生成IBS矩阵转换为三元组的形式 01、计算IBS矩阵 (base) [b20223040323@admin2 test]$ ls ## 测试数据，plink格式 top10.map top10.ped (base) 阅读全文

摘要： 001、根据第一列去重复，并保持原来的顺序，保留第一次出现的重复 [root@PC1 test]# ls a.txt [root@PC1 test]# cat a.txt ## 测试数据 e 1 a 2 e 5 e 6 d 7 c 8 c 9 [root@PC1 test]# awk '!ay1[$ 阅读全文

摘要： 001、 [root@PC1 test]# ls a.txt [root@PC1 test]# cat a.txt ## 测试数据 01 02 03 04 05 06 07 08 09 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 [root@PC1 test]# awk 'NR 阅读全文

摘要： 001、 [root@PC1 test]# ls a.txt [root@PC1 test]# cat a.txt ewrwe fdgrg dffeg cgrde qsecg cdaec zcedq dvfde wsdgg [root@PC1 test]# awk '{OFS="\t";$1=tou 阅读全文

摘要： Linux 中 awk语句中match命令。 001、 [root@pc1 test]# ls [root@pc1 test]# echo "chr1:12345-67890" | awk '{print match($0, /chr1/)}' ## 如果正确匹配，语句返回第一个匹配到的字符的位置 阅读全文