【工具使用】【服务器】基础使用及使用过程中遇到的问题和疑问

基础使用

常用命令

运行作业：sbatch --gpus=1 ./run.sh
查看作业：parajobs
取消作业：scancel 作业id 
查看作业id：squeue
查看作业运行时长：
sacct -j 作业id -X --format=JobID,JobName,Elapsed,State

 

问题

vscode使用ssh远程连接服务器失败

报错信息如下：

但连接另一个区的服务器正常。服务器工程师告知：由于高版本vscode不支持连接服务器，建议更换使用1.85.0版本的vscode，下载地址https://code.visualstudio.com/updates/v1_85

vscode 1.86版本远程ssh不兼容旧服务器问题解决 - 知乎 这篇文章提供了便携版的安装办法，以下是整理后的内容：

文章提到：vscode的1.86版本，更新了对glibc的要求，需要最低2.28版本，导致各种旧版本的linux发行版（比如最常见的centos 7）都无法用remote-ssh来连接，会一直控制台报错waiting for server log。

官方FAQ：Remote Development FAQCan I run VS Code Server on older Linux distributions?—Remote Development FAQ

1.85.2绿色便携版安装流程：

1. 点击下载链接 下载1.85.2版本的zip包，下载后解压到本地自己选择的目录下
2. 进入解压后的VSCode-win32-x64-1.85.2目录，新建data文件夹
3. 拷贝%APPDATA%\Code目录到data文件夹下，然后重命名为user-data
4. 拷贝%USERPROFILE%\.vscode\extensions目录到data文件夹下
5. 在data文件夹下新建目录tmp
6. 然后给Code.exe创建一个快捷方式，就可以正常使用1.85.2版本

插件Remote - SSH推荐单独下载安装0.107.1版本，下载地址。下载完毕后，在 VS Code 中按Ctrl+Shift+P，输入并选择 Extensions: Install from VSIX，然后选择下载的.vsix 文件进行安装。

服务器运行脚本中为何使用source activate xxx激活环境？

服务器提交作业命令：sbatch --gpus=2 ./run.sh

运行脚本run.sh中使用source activate xxx激活虚拟环境，而非conda activate xxx

而source activate xxx是Conda 4.3 及之前版本的方法。activate是一个可执行脚本，通过 source命令在当前 shell 中执行，从而修改环境变量。

根据source activate 和 conda activate 的区别和使用 - Cold_Chair - 博客园 这篇文章，是因为：sbatch命令可能因为系统的一些旧代码的遗留问题，环境中的 conda 版本很低，所以source activate xxx来激活虚拟环境。

此外，为何服务器手册中使用source activate xxx？首先，服务器使用的Miniforge，然后是下面是AI的回答：

Miniforge 作为 Miniconda 的一个替代发行版，其设计目标之一是提供一个稳定、兼容且不依赖于 Anaconda 商业仓库的开源环境。为了确保在各种 shell 配置和脚本（尤其是在服务器、集群和高性能计算环境中常见的 .sh脚本）中的最大兼容性，Miniforge 有时会默认配置为使用传统的 source activate方式。这样可以避免因用户未正确运行 conda init初始化 shell 而导致的 conda activate命令失败。

通过ssh密钥方式访问服务器

本来，直接把自己本地终端的公钥发给服务器，即可实现ssh密钥（免输密码）访问服务器，但一些商用服务器不允许这样的操作。只能由服务器下发密钥给用户。下面简单介绍这种方式的ssh配置流程（类Linux系统）。

1.将服务器下发的密钥（假设名叫sth文件）存放在~/.ssh/路径下，得到~/.ssh/id_sth文件形式。

2.修改密钥文件的权限chmod 600 ~/.ssh/id_sth

3.在~/.ssh/config文件中写入类似于下面的格式

Host sth123   
    HostName host_name
    User user
    IdentityFile ~/.ssh/sth
    IdentitiesOnly yes

4.之后直接用ssh sth123就可以直接登录服务器了。如果是第一次登录，根据提示yes就可以。