摘要: 文章解析 VariantFormer 是一种参数量达 12 亿 的分层 Transformer 模型,旨在直接从个性化二倍体基因组预测组织特异性的基因表达 。它通过整合 DNA 序列信息、遗传变异以及多层级的调控图谱,弥合了传统统计遗传学与深度学习序列建模之间的鸿沟 。 一、 模型的输入 (Inpu 阅读全文
posted @ 2026-02-04 23:00 ylifs 阅读(7) 评论(0) 推荐(0)
摘要: seq2cells 框架的模型输入、处理流程及输出细节如下: 一、 模型输入 模型的输入主要由以基因为中心的基因组序列信息组成: DNA 序列: 围绕给定基因的 转录起始位点 (TSS) 对齐的长度为 196,608 bp (约 \(200\text{ kb}\) )的 DNA 序列 。 编码方式: 阅读全文
posted @ 2026-02-04 01:30 ylifs 阅读(6) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 简单来说,Scooby 并不是在“序列”和“细胞信息”之间做二选一,而是将两者作为协同输入,通过一套巧妙的架构让它们“对话”。 以下是 Scooby 的输入、交互处理逻辑以及输出的详细拆解: 1. 核心输入:双重驱动 Scooby 的预测依赖于两类完全不同的数据输入: DNA 序列 (DNA Seq 阅读全文
posted @ 2026-02-04 01:04 ylifs 阅读(7) 评论(0) 推荐(0)