emanlee - 博客园

2020年11月3日

摘要： install.packages("tidyr") ERROR: compilation failed for package ‘tidyr’ 解决方法：安装其他版本的，不要最新版本。 make: *** [cpp11.o] Error 1ERROR: compilation failed for 阅读全文

posted @ 2020-11-03 09:13 emanlee 阅读(618) 评论(0) 推荐(0)

Centos 6 升级 gcc g++ gfortran 到 4.8.2

摘要：升级后查看版本为新的版本。但是：无法正常编译。 Paste the steps: 1. Easy installation Operating environment CentOS6.5 64bit, the original version 4.4.7, cannot support the f 阅读全文

posted @ 2020-11-03 08:32 emanlee 阅读(1366) 评论(0) 推荐(0)

2020年11月2日

解决/usr/bin/ld: cannot find -lgfortran报错

摘要： Linux编译安装OpenBLAS的时候报/usr/bin/ld: cannot find -lgfortran的错误，会发生这种情况的原因一般有下面三种原因：系统没有安装相对应的lib 相对应的lib版本不对 lib的symbolic link不对，没有连接到正确的函式库文件因为报的是lgfo 阅读全文

posted @ 2020-11-02 22:16 emanlee 阅读(2921) 评论(0) 推荐(0)

error while loading shared libraries: libmpc.so.3: cannot open shared object file: No such file or directory

摘要： error while loading shared libraries: libmpc.so.3: cannot open shared object file: No such file or directory [root@localhost mpc-1.0.3]# locate libmpc 阅读全文

posted @ 2020-11-02 20:14 emanlee 阅读(4083) 评论(0) 推荐(0)

install.packages("RcppArmadillo")

posted @ 2020-11-02 15:52 emanlee 阅读(1067) 评论(0) 推荐(0)

CentOS 6 升级 GCC 支持C++11(c++11升级包)

摘要：整个过程耗时 >4小时；升级之后，gcc可能无法正常使用，出现错误：找不到编译器。 1 查看gcc版本 [root@testtest ~]# gcc -vUsing built-in specs.Target: x86_64-redhat-linuxConfigured with: ../conf 阅读全文

posted @ 2020-11-02 14:52 emanlee 阅读(1629) 评论(0) 推荐(0)

error: ISO C++ forbids initialization of member ‘valid’

摘要： > install.packages("farver")Installing package into ‘/usr/lib64/R/library’(as ‘lib’ is unspecified)trying URL 'https://mirrors.bfsu.edu.cn/CRAN/src/co 阅读全文

posted @ 2020-11-02 09:07 emanlee 阅读(1584) 评论(0) 推荐(0)

2020年11月1日

R语言查看已加载包、卸除加载包及安装包与卸载包

摘要： 1、查看已加载的包(.packages())注意外面的括号和前面的点不能省。包被安装后，在使用前需要加载。加载包使用命令 library(包名)，比如library(codetools)。查看有哪些包是被加载的，使用命令(.packages()) ，注意小括号和点号不能省略。 2、卸除已加载的包阅读全文

posted @ 2020-11-01 23:04 emanlee 阅读(11883) 评论(0) 推荐(0)

R安装程序包：ERROR: failed to lock directory ‘/usr/lib64/R/library’ for modifying

摘要： ERROR: failed to lock directory ‘/usr/lib64/R/library’ for modifyingTry removing ‘/usr/lib64/R/library/00LOCK-stringi’ 出现错误提示：ERROR: failed to lock di 阅读全文

posted @ 2020-11-01 21:57 emanlee 阅读(1610) 评论(0) 推荐(0)

clusterProfiler

摘要： clusterProfiler也是通过KEGG API去获取物种对应的pathway注释，对于已有pathway注释的物种，我们只需要知道对应的三字母缩写， clusterProfiler就会联网自动获取该物种的pathway注释信息。在clusterProfiler中，enrichKEGG（KE 阅读全文

posted @ 2020-11-01 21:53 emanlee 阅读(1654) 评论(0) 推荐(0)